เพราะหัวใจใกล้ตับอ่อน เรื่องราวของเด็กหนุ่มมัธยมปลายที่ชอบอ่านหนังสือเป็นชีวิตจิตคนหนึ่ง (มาฮิโระ ทากาสุงิ) ที่อยู่มาวันหนึ่งค้นพบไดอารี่เล่มหนึ่งซึ่งเป็นหนังสือปกอ่อนในโรงพยาบาลมันเป็นไดอารี่ของ ซากุระ ยามาอุจิ (ลินน์) เด็กสาวเพื่อนร่วมชั้นของเขาซึ่งเขียนความลับข้างในทำให้เขารู้ว่าเธอกำลังจะตายเนื่องจากโรคตับอ่อนของและนับวันเวลาถอยหลังเรื่อยๆ นอกจากครอบครัวของซากุระแล้ว
มีเพียงเขาคนเดียวที่รู้ความลับของเธอเกี่ยวกับไดอารี่เล่มนั้น เมื่อทั้งสองเริ่มถูกชะตา เขาสัญญาที่จะเก็บความลับนั้นไว้และก็มุ่งมั่นที่จะดูแลเธอเพื่อให้เธอได้ใช้ชีวิตที่เหลืออย่างมีความหวัง อย่างไรก็ตามภาพยนตร์ได้นำเสนอหญิงสาวที่ได้รับความทุกข์ทรมานจากการเจ็บป่วยด้วยความเป็นจริงที่โหดร้าย